In March 1939 Czechoslovakia was destroyed, and the Vlára pass became a state border again — this time between the Slovak State and German-occupied Bohemia and Moravia. Nemšová was a village of the Trenčín district and shared the district's war. After the Slovak National Uprising began on 29 August 1944, German troops occupied Trenčín; after the war seven mass graves holding 69 murdered members of the resistance were found on the Brezina hill above that town. Partisan groups worked the White Carpathian ridge above the Vlára. Romanian and Soviet troops of the 2nd Ukrainian Front took Trenčín on 10 April 1945, and the places upstream in the days that followed.V marci 1939 Československo zaniklo a Vlársky priesmyk sa znova stal štátnou hranicou — tentoraz medzi Slovenským štátom a nemeckým Protektorátom Čechy a Morava. Nemšová bola dedinou trenčianskeho okresu a prežila jeho vojnu. Keď 29. augusta 1944 vypuklo Slovenské národné povstanie, nemecké vojská obsadili Trenčín; po vojne našli na Brezine nad mestom sedem masových hrobov so 69 zavraždenými odbojármi. Na hrebeni Bielych Karpát nad Vlárou pôsobili partizánske skupiny. Rumunské a sovietske vojská 2. ukrajinského frontu obsadili Trenčín 10. apríla 1945 a miesta proti prúdu v nasledujúcich dňoch.
